In Nederland komen slechts drie soorten slangen, drie soorten hagedissen en de hazelworm voor. Vrijwel al deze soorten staan door verlies aan leefgebied onder druk en zijn beschermd. Onderzoek van reptielen is over het algemeen tijdrovend, maar ook voor de uitvoering van dergelijk onderzoek beschikt Alcedo over ervaring.
Om amfibieën te onderzoeken, gebruikt Alcedo speciale schepnetten en fuiken. Het bedrijf beschikt over ruime ervaring met onderzoek van kamsalamander, knoflookpad, heikikker en poelkikker. In verband met in Nederland oprukkende schimmel- en virusinfecties wordt standaard gewerkt volgens het hygiëneprotocol van RAVON.
Onderzoek van vissen vindt doorgaans plaats binnen de kaders van de Wet natuurbescherming. Het betreft meestal soorten als grote modderkruiper en rivierdonderpad. Dergelijk onderzoek is vaak arbeidsintensief en tijdrovend omdat bijvoorbeeld vele honderden meters poldersloot moet worden bemonsterd of (delen van) beken moeten worden leeggevist.
